履约保证金绿色通道和履约保函是国际贸易中常见的两种风险控制方式，虽然它们都是为了确保买卖双方能够遵守合同义务，但在具体的运作方式上存在一些区别。

首先，履约保证金绿色通道是一种支付方式，也被称为先付款后发货。买卖双方在签订合同时，买方需要提前支付一定比例的货款作为履约保证金，以显示其诚意。一旦买方提供了履约保证金，卖方将在约定期限内完成订单，并发货给买方。履约保证金的数额可以根据交易规模和风险程度来确定，一般为合同金额的10%到30%。

履约保函则是一种担保方式，由银行或保险公司提供。在签订合同之前，卖家会向买家提供一个履约保函，保证如果卖家未能按照合同约定履行合同义务，买方可以向保函开立银行要求赔偿。履约保函相当于银行对卖方进行了信用认证，也起到了促使卖方履行合同的作用。

履约保证金绿色通道和履约保函在风险控制方面存在一些区别。履约保证金绿色通道通过提前支付货款的方式，增加了买方对卖方的信任，使得卖方更有动力按时发货。而履约保函则是通过银行的担保来确保交易的安全性，买方更加放心付款。

另外，在费用方面，履约保证金绿色通道需要买方预先支付一定比例的货款，这意味着买方需要提前占用资金。而履约保函则是由卖方支付保函费用，对买方来说相对便捷可行。

总的来说，履约保证金绿色通道和履约保函都是为了确保买卖双方能够遵守合同义务，从而降低交易风险。选择哪种方式取决于具体的情况和需求，买卖双方可以根据自身的情况进行选择。