在各类交易中，履约保证金被视为一种支付方式，以确保交易双方的承诺能够得到履行。对于发起方来说，扣除的履约保证金非常重要，因为它直接关系到资金的安全和合法性。那么，扣除的履约保证金如何入账呢？

首先，一般情况下，履约保证金是由交易平台或者中介机构进行管理和监督的。当交易达成后，如果需要扣除履约保证金，该笔款项通常会暂时冻结在交易平台或中介机构的账户中。

其次，交易平台或中介机构会根据交易双方的约定，对于扣除的履约保证金进行确认和处理。一般而言，履约保证金会被分为两部分：一部分用于抵消违约方的损失，另一部分作为交易完成后的收入入账。

对于被扣除的履约保证金用于抵消违约方的损失部分，交易平台或者中介机构会按照相应的规定和程序进行操作。这部分款项可能会通过与违约方协商一致后退还给违约方，或者用于赔偿受损方的损失。

对于履约保证金被扣除后的剩余部分，通常视为已经完成交易并转化为收入。这部分款项会根据交易平台或中介机构的内部安排进行处理和入账。一般而言，交易平台或中介机构会将该笔款项结算到自己的账户上，然后按照一定的规定和周期，进行资金的划拨或者提现操作。

需要注意的是，不同的交易平台或中介机构可能在具体的操作细节和规定上有所不同。因此，在进行交易前，双方应该仔细阅读交易平台或中介机构的相关协议和规定，了解履约保证金的具体扣除和入账方式。

总之，扣除的履约保证金一般由交易平台或中介机构进行管理和监督，根据交易双方的约定进行处理和入账。被扣除的履约保证金一部分用于抵消违约方的损失，另一部分作为交易完成后的收入入账。