银行保函和保证金是企业在经济活动中常遇到的两种支付工具，它们都有一定的成本与优劣势。

一、银行保函

银行保函是指银行为了担保企业在特定交易中履行承诺而开立的一种书面保证函。在这种情况下，银行承担责任来保证交易完成。对于需求方而言，银行保函可以提供相对灵活且低成本的担保方式。相比传统的保证金，银行保函不需要将资金占用在保证金账户中，从而释放了企业资金流动性，提高了经营效率。此外，银行保函还能够增强企业信誉度，使其在商业交易中更具竞争力。

然而，银行保函也存在一定的缺点与成本。首先，银行对于开立保函需要评估债务人的信贷风险，因此对于某些高风险企业，银行可能会拒绝开立保函，或要求较高的手续费和押金。其次，企业在使用银行保函时需要支付一定的手续费，这在一定程度上增加了企业的交易成本。最后，如果需求方发生违约行为导致保函被执行，银行将承担支付义务，而企业可能需要承受一定的法律风险和额外损失。

二、保证金

保证金是指在合同签订过程中由一方提供给另一方的一定金额的抵押物或担保金。与银行保函相比，保证金通常更适用于小额交易或信誉度较低的交易。保证金的优势之一在于简单直接，不存在评估债务人信誉度的问题。此外，保证金可以有效降低需求方的风险，确保供应方履行合同义务。

然而，保证金也存在一些不足之处。首先，保证金需要占用企业一定的资金，并冻结在保证金账户中，影响企业资金流动性；其次，保证金在实际操作过程中可能遭受部分或全部损失，从而使企业承受经济损失。

三、成本比较

从成本比较角度来看，银行保函与保证金各有优劣。银行保函对于企业而言可以释放资金流动性，提高经营效率，但需要支付一定的手续费；保证金在操作上相对简单，无需支付手续费，但会占用企业的资金。

总结起来，选择银行保函还是保证金需要企业根据具体情况进行权衡。如果企业追求资金流动性和信誉度的提高，并且能承担额外的手续费，那么银行保函可能更适合；如果交易规模较小或存在一定信用风险，且企业想要避免手续费的支出，那么保证金可能是更好的选择。