投标保函是指在投标过程中，投标人提供给招标人的一种担保方式。它通常由银行或保险公司出具，并保证在中标后，投标人能够按照合同约定履行其义务。

那么，投标保函应该由哪个部门来保管呢？根据实际情况，在大多数情况下，投标保函的保管工作由投标项目的相关部门来负责。

首先，投标保函与招标文件紧密相关，通常在招标文件中有明确的要求，规定了投标保函的提交和保管方式。因此，在投标过程中，招标人会指派专门的部门或人员来管理和保管投标保函。这些部门或人员具备相关的专业知识和经验，能够正确理解和处理投标保函的内容和要求。

其次，投标保函的保管涉及到重要的法律和财务事项。例如，在投标成功以后，投标保函可能需要被招标人作为履约保函来使用。在这种情况下，保管投标保函的部门需要与招标人的财务、合同等相关部门进行密切合作，确保投标保函的安全和有效使用。

此外，投标保函的保管还涉及到信息的保密性。投标保函中通常包含了投标人的重要商业和财务信息，这些信息可能涉及商业秘密或敏感信息。因此，在保管投标保函过程中，需要采取相应的措施来保护这些信息的安全性和机密性。

综上所述，投标保函的保管工作由投标项目的相关部门承担。他们具备专业知识和经验，能够正确理解和处理投标保函的内容和要求，并与招标人的其他相关部门密切合作，确保投标保函的安全、有效和机密。