在商业交易中，预付款保函和履约保函是两种常见的保函方式。然而，有时候这两种保函的期限可能会出现重叠的情况，这对于交易双方来说可能会带来一些疑虑和困扰。

首先，让我们了解一下预付款保函和履约保函的含义和作用：

预付款保函是指卖方向买方发出的，保证在特定时间内按合同约定提供货物或服务，并以买方支付的预付款项为基础的一种担保函。一般情况下，预付款保函的期限较短，通常是合同签订后的一个月至三个月。

履约保函是指为确保合同义务的履行,由卖方在买方要求提供并经银行开立、签发的，以该行自己名义和信誉对买方进行的一种担保函。履约保函的期限一般是根据合同约定的交货时间确定的。

当预付款保函和履约保函的期限重叠时，双方可能会面临以下问题：

1. 付款和履约的时间安排：双方需要协调好预付款和货物交付的时间，避免出现混乱和冲突。一方面，买方希望尽早收到货物或服务，而另一方面，卖方也希望能够及时收到预付款。双方需要就付款和交付的具体日期进行协商和确认。

2. 银行保函的申请和开立：当预付款保函和履约保函的期限重叠时，卖方需要向银行提交相应的申请，并确保两种保函能够按时开立。同时，买方也需要配合提供相关的文件和信息，以便顺利完成保函的开立工作。

3. 合同条款的调整：在预付款保函和履约保函的期限重叠的情况下，双方可能需要重新审视合同条款，并对其中涉及支付和交付时间的约定进行调整和修改，以适应双方的需求和保证顺利的交易进行。

为了解决以上问题，双方可以采取以下措施：

1. 提前沟通和协商：双方在签订合同之前，应当详细地沟通和协商预付款保函和履约保函的相关事宜，并明确双方的需求和期望。在签订合同之后，及时地沟通和调整两种保函的期限，以及付款和交付的时间安排。

2. 灵活处理期限重叠：对于预付款保函和履约保函的期限重叠的情况，双方应当灵活应对，在保证自身权益的前提下，妥善处理好预付款和货物交付的时间问题。根据实际情况，可以适当延长或缩短某种保函的期限，以便更好地适应双方的需求。

3. 寻求第三方协助：如果双方无法就预付款保函和履约保函的期限达成一致，可以寻求第三方专业机构的协助，如律师或仲裁机构等，通过咨询和调解来解决纠纷，以保障交易双方的利益。

总之，预付款保函和履约保函的期限重叠可能给商业交易带来一定的困扰，但通过双方的积极沟通和灵活处理，可以有效地解决问题，保证交易的顺利进行。