银行保函是一个专业的金融工具，在各类商业交易中起到重要的作用。银行保函的收费方式也是商业合作中需要考虑的关键问题之一。

一般来说，银行保函的收费方式可以分为以下几种：

第一种是按金额比例收费。这种方式是根据银行保函金额的大小来确定收费标准，通常在合同中会明确规定具体的比例。例如，如果保函金额为100万元，按照1%的比例来计算，则收费金额为1万元。这种收费方式相对简单明了，但会因保函金额的不同而有所差异。

第二种是按期收费。也就是根据保函的有效期限来计算收费金额。一般来说，保函的有效期为一年，按年收费。例如，如果保函的年费率是1%，则保函金额为100万元的话，年费就是1万元。这种方式适用于长期合作的商业伙伴，能够提供更加稳定的服务。

第三种是固定费用收费。即无论保函金额多少、有效期多长，都按照固定的费用来收取。这种方式相对来说较为简单和便捷，适用于保函金额不大、有效期不长的情况。

除了以上几种常见的收费方式外，还有一些特殊情况下的收费方式。比如，如果需要加急办理保函，银行可能会额外收取相应的加急费用；如果保函涉及跨国交易，可能会存在相关的国际手续费等。

在选择收费方式时，双方需要充分沟通和协商，根据具体的合作需求来确定最合适的收费方式。同时，还需要注意到银行保函的收费不仅包括银行的服务费，还可能包括其他相关费用，如审查费、咨询费等。因此，在合作过程中要注重费用明细的确认和合规性的检查，以避免发生纠纷。

总之，选择合适的银行保函收费方式对商业合作的顺利进行起着至关重要的作用。只有在双方均满意的情况下确定好收费方式，才能够确保双方权益的平衡和风险的控制。