工程担保保函是在建筑工程和工程施工领域中，常见的一种商业信用工具。它是由债权人（通常是业主或融资机构）要求承包商提供的一种担保形式，以确保工程能够按时完工，并满足合同规定的质量标准。

那么，工程担保保函由谁提交申请呢？实际上，通常是由承包商向债权人提交工程担保保函的申请。

为了更好地理解这个问题，我们先来看一下承包商和债权人在工程担保保函中所扮演的角色。

首先，承包商是施工工程的执行主体，他们承担着工程完成的责任和风险。在施工过程中，承包商需要履行合同规定的各项义务，包括按时完工、保证工程质量等。

而债权人则是施工工程的拥有者或者出资机构，他们为开展工程投入大量资金，并且对工程的进展和质量有较高的要求。为了保证自己的利益和资金安全，债权人通常会要求承包商提供一定的担保措施。

在这种情况下，工程担保保函就应运而生了。它是一种由银行或担保公司为承包商提供的担保形式，也是一种约定，承包商在合同上和银行或担保公司签订担保合同，并按照合同规定支付担保费用。

债权人可以根据自己的需求和要求来确定工程担保保函的金额和有效期限。当工程进展顺利并达到约定标准时，债权人无需使用保函；而当发生工期延误、工程质量问题等情况时，债权人可以向保函担保方索赔，以保证自己的权益。

因此，承包商作为保函的申请方，需要根据合同要求与银行或担保公司进行沟通，并提交相关申请材料。一般来说，承包商需要提供工程进度计划、施工方案、资质证书、银行开户许可证等文件来支持保函的申请。

总之，工程担保保函由承包商向债权人提交申请。通过提交相关的申请材料，并按照合同和协议的规定履行义务，承包商能够获得保函的担保，并利用保函来满足债权人对工程安全和质量方面的要求。