支付履约保函是指在合同中，买卖双方约定采取保函形式来担保交易中的付款或者回款义务。这种方式可以有效地保护买卖双方的权益，并且提高交易的可信度。对于合同中的保函款项，如何做账是一个重要环节。

首先，进行保函收入的会计处理。一般而言，保函款项在签发之后，收款人将保函提交给银行以获得相应的支付，再将收到的支付转入企业账户中。在做账时，应该将保函收入视为一笔资金流入，通过记账凭证进行记录。记账凭证的借方应为银行存款账户，贷方则根据具体情况而定。如果是因为销售商品或提供服务而产生的保函，那么贷方应该是对应的收入科目；如果是作为手续费或利息的保函，则贷方应该是相应的费用或利息支出科目。

其次，需要进行保函支出的会计处理。在合同中，如果有保证金或押金存在，那么在遵循相关法规和政策的前提下，收款人可能要提供相应金额的保函来作为担保。这时，支出的款项应该被视为一笔现金流出，并且需要通过记账凭证进行记录。具体而言，记账凭证的借方应该是保函支出科目，贷方则为银行存款账户。

此外，还需要注意在对保函进行做账时，要对与之相关的费用进行核算。包括保函开立过程中所产生的手续费、经办费等各类费用，以及利息等额外成本。在记账凭证中，这些费用和成本应该视为支出并进行相应的记录。记账凭证的借方和贷方根据费用性质而定，可以是费用科目或其他适当的科目。

最后，在完成支付履约保函的会计处理后，还应该及时进行账务确认和调整。及时核实账目，确保收入和支出的准确性。如果发现错误或遗漏，应该及时进行更正，并进行相应的调整。这样可以避免因为账目不清晰而带来的混淆和纠纷。

总的来说，支付履约保函的做账工作需要细致地进行，确保记录准确、清晰。通过正确的会计处理，可以更好地管理和控制买卖双方的权益，并提高交易的透明度和安全性。