保函是一种由银行或保险公司发出的书面担保，用于保证某一方在履行合同或承担责任时的经济能力。在一些商业交易中，需要提供保函作为担保的一种形式。其中，保函保证金是指保函受益人要求委托人提供的金额，以确保委托人按照约定完成合同或履行义务。

常见的情况是，当委托人违反合同条款，无法正常履行合约义务时，受益人可以向保函开立银行主张权利，并要求支付保证金作为损失赔偿。保函的目的就是为了保障受益人利益，在委托人违约的情况下能够得到相应的补偿。一般来说，保函保证金应该全额支付给受益人。

然而，在一些情况下，保函保证金的全额支付可能会对委托人造成过大负担，导致其资金周转不畅或无法继续经营。因此，在特殊情况下，委托人有时会希望能够部分支付保函保证金。

关于保函保证金能否部分支付，不同地区和不同的相关法律可能会有所差异。一般来说，在没有明确规定的情况下，双方应当根据合同约定进行协商并达成共识。如果双方同意部分支付保证金，委托人必须向受益人提供充足的理由，并经过受益人同意后方可进行。

但需要注意的是，部分支付保函保证金可能会增加风险。一旦发生违约行为，受益人只能按照实际收到的金额来追偿，无法全额获得损失赔偿。因此，在决定是否部分支付保证金时，委托人需权衡利弊，确保自身的利益不会受到太大影响。

在一些国家和地区，政府对于保函保证金的部分支付可能会有一定的限制或规定。因此，委托人在决策时应充分了解当地的法规和要求，并咨询专业人士的意见。只有在符合相关法规、受益人同意，并经过认真的权衡后，委托人才能考虑部分支付保函保证金。

综上所述，保函保证金一般应全额支付给受益人。尽管在特殊情况下，委托人可能希望能够部分支付保证金，但这需要经过充分协商和受益人同意，并需要权衡利弊与法规限制。委托人应当对风险有清晰的认识，并咨询专业人士的意见，以便做出正确的决策。