履约保证金是在合同签订过程中常见的一个概念。它是为了确保当事人之间按照合同约定履行自己的义务而设立的一项资金或财产保证。

然而，关于履约保证金是否可以从合同中扣除，观点存在分歧。

一方面，有人认为，履约保证金应该作为一种特殊形式的担保，不应用于违约赔偿。在这种观点下，履约保证金只能通过双方协商或法院判决的方式进行返还。它不能被当作一种罚金或赔偿金来扣除。

另一方面，也有人持相反意见，认为履约保证金可从合同中扣除。他们认为，履约保证金既是一种履行义务的担保，同时也是对违约方造成的损失的补偿。因此，当违约发生时，合同可以规定将履约保证金作为违约方应支付的赔偿金而扣除。

需要注意的是，对于履约保证金能否从合同中扣除，具体以签订的合同条款和适用法律规定为准。在商业合同中，双方可以根据具体情况协商确定是否可以将履约保证金作为违约赔偿。同时，法院也会根据合同约定和相关法律进行判断和裁定。

无论履约保证金是否可从合同中扣除，其本质目的都是为了保障合同的履行。它起到一种信任、约束和激励的作用，促使当事人更加认真地履行合同义务，降低违约的风险。

在选择和签订合同时，当事人应充分考虑履约保证金的设置和相关规定。明确履约保证金的使用范围和退还条件，避免可能的争议和纠纷。

总之，履约保证金是否可从合同中扣除，在实践中存在不同的观点和处理方式。在签订合同时，应根据实际需求并参照适用法律，合理设置履约保证金条款，以确保合同的有效履行和双方权益的保障。