工程保函费用有发票吗？这是很多人在办理工程保函时常问的一个问题。工程保函作为一种银行业务贷款担保工具，被广泛应用于建筑施工、工程承包等领域。但关于保函费用是否有发票的问题，很多人并不清楚。

首先，我们需要明确一点，保函费用是由申请人支付给出具保函机构的手续费用。而出具保函机构作为商业服务提供方，在向申请人收取费用后会开具相应的发票，以便申请人进行报销或者核算。所以，实际上工程保函费用是可以开具发票的。

然而，需要注意的是，工程保函费用的发票类型并非普通商品的销售发票，而是属于专用票据。根据我国税务法规定，保函费用发票属于增值税专用发票的范畴。

与普通发票相比，增值税专用发票在开具程序和使用限制上都有所不同。根据相关税法规定，专用发票是由税务部门统一印制发行的，并且只有特定纳税人才能开具。对于工程保函费用的开具，可以由专门经办保函业务的银行或者担保公司进行。

申请人在支付保函费用后，可向出具保函机构索要发票。出具保函机构会根据国家税务部门的规定，在开具发票时填写相应的信息，包括纳税人识别号、名称、金额等。同时，申请人也需要提供相关的资料，以便保函机构办理开具发票的手续。

在实际操作中，申请人可能需要提前告知出具保函机构是否需要开具发票，并提供纳税人识别号等相关信息。因此，在选择保函机构及签订合同时，应与对方明确约定有关费用开具发票的事项。

总结起来，工程保函费用是可以开具发票的。保函机构会按照国家税务部门的规定，为申请人开具增值税专用发票。但我们在办理工程保函业务时，需与出具保函机构提前沟通确认，明确费用开票的具体事宜。