履约保证金是常见的商业交易中的一种担保措施，用于保证合同双方在交易过程中按照约定履行各自的义务。然而，有时候履约保证金的时间限制可能会超时，引发一系列问题。

当履约保证金超时时，首先需要明确违约方是谁。如果是买方违约，卖方可以根据合同条款采取相应的违约责任追究方式，如要求支付违约金、解除合同等。如果是卖方违约，买方也可以采取相应的追究方式，例如要求退还履约保证金并寻求赔偿。

接下来，解决履约保证金超时问题的重点是确定违约方是否有合法的理由导致超时。合同一般为双方提供了违约免责情形和违约责任条款。如果违约方能够证明其有正当的理由未能按时支付履约保证金，比如遭遇不可抗力等情况，那么超时可能会被免责。否则，违约方需要承担相应的违约责任。

在处理履约保证金超时问题时，双方可以寻求第三方调解或仲裁机构的帮助。这些机构可以根据合同约定和相关法律法规，对超时问题进行专业的调查和判断，并据此提出调解建议或做出仲裁决定。双方应尊重并遵守第三方机构的裁决结果。

如果双方无法通过谈判、调解或仲裁解决履约保证金超时问题，可以向法院提起诉讼。在诉讼过程中，法院将依法审理该案件，并根据事实和法律作出判决。然而，诉讼需要耗费时间和金钱，可能会给双方带来额外的损失和风险，因此在诉讼前要慎重考虑。

总体而言，当履约保证金超时时，双方应首先明确违约方是谁，然后根据合同条款和相关法律法规采取相应的追究方式，如调解、仲裁或诉讼等。同时，在日常商业交易中，双方还应更加注重履约保证金的有效管理和控制，以避免类似问题的发生。