工程履约保函是在工程合同中常见的一种履约担保方式，它是施工方为向业主提供保证，承诺履行合同中所规定的义务而提供的担保措施。而工程履约保函单保证金则是在工程履约保函中的一项要素，它是用来确保施工方能够履行合同义务，避免违约行为产生的。

工程履约保函单保证金的具体金额通常由双方在合同中约定，一般以工程合同金额的一定比例来确定。具体的比例标准可以根据工程的性质、规模、难易程度以及实际情况进行协商确定。一般来说，工程履约保函单保证金占合同金额的比例在5%至10%之间。

工程履约保函单保证金的缴纳方式通常分为两种：一种是一次性缴纳，即施工方在合同签订时一次性缴纳全部的保证金；另一种是分期缴纳，即施工方按照合同约定的进度分期缴纳保证金。

工程履约保函单保证金的用途主要包括以下几个方面：

首先，保证金可以确保施工方能够按照合同的要求履行工程建设，并保证工程的质量。如果施工方没有按照合同约定完成工程，业主可以通过索赔的方式来要求返还保证金。

其次，保证金可以用于弥补业主因施工方违约造成的损失。如果施工方发生违约行为，导致工程无法按照合同要求进行或者质量不达标，业主可以通过索赔的方式来要求从保证金中扣除相应的损失。

最后，保证金还可以作为违约责任的一种措施，对于违约方来说具有一定的威慑作用。施工方如果违反了合同的约定，不仅要承担返还保证金的责任，还可能面临一定的违约金或者其他法律责任。

工程履约保函单保证金的退还通常有两种情况：一种是工程顺利竣工并经业主验收合格后，保证金会在一定期限内全额退还给施工方；另一种是在工程期间，保证金会逐步退还给施工方，根据工程进度款支付的比例来确定。

总之，工程履约保函单保证金的金额应根据具体情况进行协商确定，并有具体的退还方式，以保证双方的合法权益。对于施工方来说，缴纳工程履约保函单保证金是一种责任和约束，有助于规范工程的施工行为，确保工程的顺利进行和质量的保障。