保险保函和银行保函是商业保险中常用的两种担保方式。虽然它们都是为了提供保证，但在具体的使用和效果方面有一些不同。

首先，保险保函主要是由保险公司提供的，用于对被保险人的债务履行进行担保。在这种情况下，保险公司作为一个第三方，提供了一种经济安全网，可以确保债权人在债务人无法履行债务时能够获得赔偿。保险保函一般适用于商业交易、工程项目等场景，能够为债权人提供一定的保障。

而银行保函则是由商业银行提供的担保方式，用于保证债务人能够履行其合同责任。这种方式下，银行作为债务人与债权人之间的担保人，向债权人提供一定的担保，确保债务人按照合同约定履行义务。常见的银行保函包括投标保函、履约保函等。相比于保险保函，银行保函更加受到商业交易的青睐。

其次，在费用方面，保险保函和银行保函的费用计算方式有所不同。保险保函的费用一般按照保函金额的比例进行计算，通常为保函金额的一定比例，这个比例根据债务人的信用状况、债务性质等因素而定。而银行保函的费用则是按照债务人的信用评级、保函期限、债务金额等因素进行计算的，费用比例一般较低。

此外，在使用的灵活性方面，保险保函相对更为灵活。保险保函可以根据具体情况进行定制，根据债务人的需求和债权人的要求，进行特殊条款的添加或调整。而银行保函一般采用标准化的条款，相对较少特别条款的存在。

最后，就赔偿能力而言，保险保函的赔偿能力更强。保险公司作为专业的保险机构，具有较强的资金实力和风险管理能力，一般能够更好地履行赔偿义务。而银行在提供保函的同时，并不向债权人提供赔偿承诺。

综上所述，保险保函和银行保函在提供担保服务的方式、费用计算、灵活性以及赔偿能力等方面存在一些不同。根据实际需求，债务人和债权人可以选择适合自己的担保方式。