工程保函是指在工程项目中为保证工程质量和安全而向相关方提供的一种担保方式。工程保函费用是指保证人为提供工程保函所收取的一定费用。那么工程保函费用应该计入什么科目里呢？

根据财务会计准则，工程保函费用应计入管理费用科目。管理费用是指企业为完成指定管理职能所发生的费用，包括薪酬支出、办公费用、差旅费用、市场推广费用等。工程保函费用作为一种管理费用，主要体现了企业管理层为提高工程质量和保证项目安全而采取的一种措施。

在具体会计处理中，工程保函费用应计入管理费用的细分类别中。根据企业实际情况，可以设立相应的科目代码，例如“管理费用-工程保函费用”。同时，在费用报表中应单独列示并明细披露工程保函费用金额，以便分析和监控企业在工程保函方面的支出情况。

需要注意的是，在将工程保函费用计入管理费用科目时，应遵循相关会计准则和规定，确保会计处理准确合规。同时，在内部控制方面，企业应建立相应的审核和审批制度，确保工程保函费用的合理性和合规性。

总之，工程保函费用应计入管理费用科目中，作为一种管理费用的细分类别进行处理。企业在会计处理时应遵循相关准则，并建立相应的内部控制制度，以确保工程保函费用的正确计提和合规使用。